位于东京西部的巨大“学园都市”。在总人口达230万人，其中约8成是学生的这座都市中，实施着超能力开发的特殊课程，学生们的能力被给予从“无能力Level 0”到“超能力Level 5”的六阶段评价。高中生上条当麻，也是住在学园都市的学生之一…

高中毕业，心中留存着通过游泳联系起来的羁绊，向着各自的未来迈出步伐的遥等人。遥在东京和曾经一起游过接力赛的旭重逢了。遥中学时的记忆被唤醒。在他的心中苏醒的，是“那时”郁弥的身姿。和遥一起上京的真琴，开始向新的梦想迈进，而…

不愿继承家业粗点心店的鹿田九，与热爱粗点心的不可思议美少女·萤。萤为了让九继承粗点心店，而开始屡次造访店中。与萤一同度过的九顺利地前进在成为粗点心店长的道路上……是不是这样还不清楚，不过与友人远藤豆、远藤彩一同度过的愉快…

在学园都市制作的宇宙升降机“恩底弥翁”完成在即之时，上条当麻和茵蒂克丝与拥有“奇迹”的歌声的少女鸣护阿丽莎相遇，然而阿丽莎却会引发魔法世界和科学世界之间的战争，故事也由此展开。

故事讲述的是从东京都西部被分割出来的这座都市中，“超能力开发”被列为学校课程的一部分。在二百三十万人口中，有八成都是学生，所以被称为学园都市。他们每天都在超能力开发上进行相互竞争。根据能力不同，可以分为6级，从无能力（Lv…

公元2016年——。在釜谷市的天万神社做着巫女工作的初中2年生，皇缠。自幼与母亲分别的她，长年被寄养在祖父母的家中，从三个月前开始终于和父亲伸吾一起生活。也许是因为有过这种境遇的缘故，缠向往着平凡而安稳的日常。缠的好友、同时…

平静的风吹过美丽的大地——阿斯特莱亚大陆。在大陆的某个角落，失去记忆的少年佑树醒了过来，照顾他的小小指引者可可萝、总是饿肚子的美少女剑士佩可莉姆、有一点冷酷的猫耳魔法少女凯露，在命运的指引下，他们创立了名为“美食殿堂”的…

在本作舞台的2030年代世界中，被称为“西欧财阀”的巨大组织利用财力、武力进行世界规模的彻底性资源管理，所以技术以及人类的进步正停滞不前。因此表面上技术从2000年代起就没有改变。 此作的世界观与TYPE-MOON多作共通的世界观基本设定…