豪尔(罗根·勒曼饰)因一部小说而瞬间成名，然而其作品也发展了一出悲剧，他的事业似乎蒙上了阴影，而他过去的黑暗秘密也变得越来越复杂。

尼奥（基努·里维斯 Keanu Reeves 饰）和崔妮蒂（凯瑞-安·莫斯 Carrie-Anne Moss 饰）重回矩阵：在这里，一个是矩阵创造出来，周而复始的日常世界，另一个则是隐藏其后，真实的人类世界。为了弄清楚自己所处的“现实”究竟是真是假，尼…